Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gtf2e1Q9D0D5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms