Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rrs1Q9CYH6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms