Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sgo1Q9CXH7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sgo1Q9CXH7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sgo1Q9CXH7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sgo1Q9CXH7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sgo1Q9CXH7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Sgo1Q9CXH7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Sgo1Q9CXH7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Sgo1Q9CXH7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Sgo1Q9CXH7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sgo1Q9CXH7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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