Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd4Q9CWX4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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