Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Khdc3Q9CWU5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Khdc3Q9CWU5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms