Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NubplQ9CWD8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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