Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm26657Q9CVR1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm26657Q9CVR1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms