Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sycp2Q9CUU3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sycp2Q9CUU3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms