Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4930553M12RikQ9CUH1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930553M12RikQ9CUH1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms