Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fcf1Q9CTH6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms