Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chchd3Q9CRB9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chchd3Q9CRB9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms