Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mri1Q9CQT1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mri1Q9CQT1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms