Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PsenenQ9CQR7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms