Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrpb2Q9CQI7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms