Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl11Q9CQF0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms