Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg3Q9CPX6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg3Q9CPX6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms