Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW5

Ssr2, Translocon-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr2Q9CPW5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssr2Q9CPW5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr2Q9CPW5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr2Q9CPW5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr2Q9CPW5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr2Q9CPW5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr2Q9CPW5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr2Q9CPW5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr2Q9CPW5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms