Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CPS8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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