Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim3Q99PE5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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