Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tsnaxip1Q99P25 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms