Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gtf2ird2Q99NI3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird2Q99NI3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms