Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tdrd1Q99MV1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tdrd1Q99MV1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms