Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gtpbp4Q99ME9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms