Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp1b4Q99ME6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atp1b4Q99ME6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms