Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtprtQ99M80 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtprtQ99M80 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms