Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gdpd3Q99LY2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms