Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp16Q99LG0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms