Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pagr1aQ99L02 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1aQ99L02 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms