Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TriobpQ99KW3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms