Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dok4Q99KE3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dok4Q99KE3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms