Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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TrabdQ99JY4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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