Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX1

Taf11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf11Q99JX1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Taf11Q99JX1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms