Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Ddb2Q99J79 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ddb2Q99J79 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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