Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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