Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sfxn4Q925N1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sfxn4Q925N1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Sfxn4Q925N1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Sfxn4Q925N1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms