Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf144aQ925F3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms