Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim59Q922Y2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms