Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf3Q922U1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf3Q922U1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms