Protein–RNA interactions for Protein: Q922D8

Mthfd1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1Q922D8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mthfd1Q922D8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mthfd1Q922D8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms