Protein–RNA interactions for Protein: Q921E6

Eed, Polycomb protein EED, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EedQ921E6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EedQ921E6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms