Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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Afg3l1Q920A7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Afg3l1Q920A7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Afg3l1Q920A7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Afg3l1Q920A7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms