Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Creb3l3Q91XE9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms