Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps11Q91W86 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms