Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp3Q91W36 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Usp3Q91W36 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms