Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps4aQ8VEJ9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps4aQ8VEJ9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms