Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nae1Q8VBW6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms