Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BbxQ8VBW5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BbxQ8VBW5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms