Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmx1Q8VBT0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmx1Q8VBT0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms