Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8R3C1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8R3C1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms