Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg10Q8R1P4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms